Amidaza (AMD)
Enzimi:Su makromolekularni biološki katalizatori, većina enzima su proteini
Amidaza:Kataliziraju hidrolizu različitih endogenih i stranih alifatskih i aromatskih amida prijenosom acilne skupine u vodu uz stvaranje slobodnih kiselina i amonijaka. Hidroksamske kiseline i druge organske kiseline široko se koriste kao lijekovi jer su sastojci faktora rasta, antibiotika i inhibitora tumora. Amidaze se mogu podijeliti na acilaze tipa R i tipa S prema stereoselektivnosti katalizatora.
Osim što katalizira hidrolizu amida, amidaza može također katalizirati reakcije prijenosa acila u prisutnosti kosupstrata poput hidroksilamina.
Amidaze iz različitih izvora imaju različitu specifičnost supstrata, neke od njih mogu hidrolizirati samo aromatske amide, neke samo alifatske amide, a neke hidroliziraju α- ili ω-amino amide. Većina amina ima dobru katalitičku aktivnost samo za acikličke ili jednostavne aromatske amide, ali za složene aromate, heterociklički amidi, posebno amidi s orto supstituentima, općenito su niske aktivnosti (samo nekoliko enzima pokazuje bolje katalitičke učinke).
Katalitički mehanizam:
| Enzimi | Šifra proizvoda | Šifra proizvoda |
| Enzimski prah | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | set od 19 amidaza, 50 mg svaka 19 artikala * 50 mg / artikal ili druga količina |
| Komplet za probir (SynKit) | ES-AMD-1900 | set od 19 amidaza, 1 mg svaka 19 artikala * 1 mg / artikal |
★ Visoka specifičnost supstrata.
★ Jaka kiralna selektivnost.
★ Visoka učinkovitost pretvorbe.
★ Manje nusproizvoda.
★ Blagi uvjeti reakcije.
★ Ekološki prihvatljivo.
➢ Probir enzima treba provoditi za specifične supstrate zbog specifičnosti supstrata te odabrati enzim koji katalizira ciljni supstrat s najboljim katalitičkim učinkom.
➢ Nikada ne dodirujte ekstremne uvjete kao što su: visoka temperatura, visoki/niski pH i organska otopila visoke koncentracije.
➢ Normalno, reakcijski sustav treba uključivati supstrat, pufersku otopinu (optimalni pH reakcije enzima). Kosupstrati poput hidroksilamina trebaju biti prisutni u reakcijskom sustavu prijenosa acila.
➢ AMD treba dodati zadnji u reakcijski sustav s optimalnim pH i temperaturom reakcije.
➢ Sve vrste AMD-a imaju različite optimalne uvjete reakcije, stoga svaku od njih treba dalje proučavati pojedinačno.
Primjer 1(1):
Aktivnost hidrolize na različite amidne supstrate
| Podloga | Specifična aktivnost μmol min-1mg-1 | Podloga | Specifična aktivnost μmol min-1mg-1 |
| Acetamid | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12,8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butiramida | 11,9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| Izobutiramida | 26.2 | ο-Toluamid | 0,3 |
| Pentanamid | 22,0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Heksanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1,7 |
| Cikloheksanamid | 19,5 | Izonikotinamid | 1,8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrilamid | 3,5 | 3-fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | Indol-3-acetamid | 1,9 |
| Benzamid | 6,8 |
Reakcija je provedena u 50 mM otopini natrijevog fosfatnog pufera, pH 7,5, na 70 ℃.
| Amidi | Hidroksilamin | Hidrazin |
| Acetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18,4 | 3.0 |
| Izobutiramida | 25,0 | 22,7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reakcija je provedena u 50 mM otopini natrijevog fosfatnog pufera, pH 7,5, na 70 ℃.
Povezana koncentracija reagensa: amidi, 100 mM (benzamid, 10 mM); hidroksilamin i hidrazin, 400 mM; enzim 0,9 μM.
Primjer 2(2):
Primjer 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Ekstremofili, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR i dr. Procesna biokemija, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM i dr. Bioorganska kemija, 2017., Dostupno online 7.
